Gedung Madrasah Tsanawiyah An-Nur Kota Cirebon terletak di Desa Kutagara Selatan Kota Cirebon dan berdiri sejak tahun 1993 sesuai Surat Keputusan dari Kantor Wilayah Departemen Agama No. WI/PP.0551/1993/. dan pada tanggal 22 Mei Madrasah Tsanawiyah An-Nur Kota Cirebon resmi berdiri dengan Surat Keputusan No. WI/PP.0551/1993/.
MTs An-Nur ini berada di bawah naungan Yayasan Pendidikan dan Dakwah Islam Jagasatru (YPDIJ) didirikan pada tanggal 06 Agustus 1983 oleh 33 orang pemrakarsa, yang terdiri dari tokoh masyarakat dan aparat pemerintah, dan didukung oleh masyarakat setempat.
Pada Awalnya yakni tahun pelajaran 1993/1994 siswa MTs An-Nur hanya terdiri 1 kelas dan berjumlah 49 siswa. kemudian dari tahun ketahun terus bertambah hingga 9 kelas sampai sekarang.
